微山县 微山湖（南四湖），微山湖、昭阳湖、独山湖、南阳湖等四个相连湖的总称，但由于微山湖面积比其它三湖较大，习惯上统称微山湖，主要水体位于山东省南部微山县。全湖面积1266平方公里（190万亩），中国北方最大的淡水湖。
任城区 太白湖及右侧塌陷湿地，太白湖原名北湖、小北湖，属于南四湖的南阳湖的最北端，上世纪七十年代与南四湖人工隔开，总水面积12平方千米（1.8万亩）
梁山县 聚义湖及平原水库，平原水库，水体面积1.27平方千米（1900亩）
曲阜市 尼山水库（孔子湖），尼山脚下，建成于1960年9月，水体面积6.7平方千米（近1万亩）
曲阜市 韦家庄水库-河家店水库-梨园水库，三座水库总面积1.3平方千米（1950亩）
邹城市 西苇水库（孟子湖），总库容为1.02亿立方米，建成于1960年6月，总水体面积6.56平方千米（近1万亩）
泗水县 贺庄水库，建成于1976年10月，总水体面积5.77平方千米（8650亩）
泗水县 龙湾套水库，泗水县第二大水库，1960年3月工程竣工，总水体面积4.15平方千米（6225亩），泗水县境内还有华村水库等
汶上县 莲花湖，省级湿地公园，国家4A级旅游景区，总面积2.9平方千米（4350亩）
金乡县 金平湖，共三块水域，总面积1.86平方千米（近2800亩），此外金乡县西北还有金水湖国家湿地公园。
嘉祥县 人工湖 ，具体名称不清（有了解的请评论），0.47平方千米（近700亩）
兖州、曲阜、邹城三地交界因塌陷形成的人工湖湿地，部分已经治理，因塌陷受影响区域50多平方千米（全济宁地区塌陷区域近100平方千米）（图为2010年影响最严重时水域面积）
兖州区，除塌陷区外并无明显湖泊水库，泗河从城东穿过
鱼台县 并无大型湖泊水库，境内众多河流穿城而过
